Ahora, después de haber sido "rechazado" por la derecha cristiana, Haggard describe su situación, su énfasis con respecto a las relaciones del mismo sexo se ha suavizado. A pesar de que todavía cree que el matrimonio del mismo sexo bíblicamente es inadmisible, ahora muestra su apoyo en relación a las uniones civiles de personas del mismo sexo. "Así como la iglesia cometió un terrible error hace varios siglos insistiendo que la tierra era plana," manifestó Haggard, "creo que la iglesia puede cometer un gran error en nuestra generación decir que la sexualidad debe ser esto y nada más." Además añadió "La Iglesia deber ver la humanidad realísticamente. Todos tenemos que ser humildes y hacer todo lo posible para servir a las personas necesitadas. No juzgarlas; sin odio, y sin castigarlos". Desde su caída, Haggard ha manifestado amargamente que esperaba que la comunidad cristiana hubiese tenido más misericordia y perdonarle en una forma distinta a como lo ha hecho. Recientemente una reunión en un Seminario Teológico en Nueva York manifestó que "cada vez que cae un líder político o religioso destacado es nuestra oportunidad para demostrar el Evangelio al mundo secular, pues es quizás el único momento en que estemos expuestos a las cámaras". El pasado mes de noviembre Haggard reveló haber sido abusado sexualmente por un hombre cuando tenía siete años y que esta experiencia que ha tenido repercusiones en su identidad sexual. Actualmente se define como un "heterosexual con problemas", y afirma que todavía tiene luchas con su sexualidad, pero que su matrimonio es ahora más fuerte que nunca. También dijo que nunca ha pensado en abandonar el cristianismo.